文献管理保姆级教程

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1. 文献管理工具的选择

工欲善其事必先利其器。

文献管理软件很多,常用的有以下几款:

Endnote, 老牌且大牌的文献管理工具,背靠 Clarivate Analytics,能提供相当准确的文献信息。但价格昂贵,Endnote 20 的标准许可证售价¥1688,学生版也要¥898。好在和很多高校有合作,如果所在的学校提供免费许可的话,Endnote 是个不错的选择。个人觉得功能丰富,全面,文献信息准确,移动端体验不错,但“太重”。

Endnote 功能

Mendeley,早年是一个开源项目,后被 Elsevier 收购,可自动抓取的文献信息,成功率很高。支持导出多种格式的参考文献信息。全平台(Windows, MacOS, iOS, Android), 对于有多平台切换需求的用户比较友好。免费提供 2GB 的在线空间,对大多数用户都足够了,因为是用于文献管理,而不是文献收藏,并不需要永久保存大量的文献。个人体验,在线访问速度略慢,界面简洁美观,桌面版的还是感觉“太重”。

NoteExpress,国货精品,个人使用不多,和 CNKI E-Study 一样,对中文文献支持较好。

CNKI E-Study,不用过多介绍,都用过:)

JabRef,遵循 GUI 的开源项目,提供文献信息的导入,编辑,导出。第一次看到这个软件是在一本 Latex 的教材里。个人没有使用过,不作过多介绍。

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JebRef

Zotero: 一个开源项目,目前依然在开源状态,不存在盗版的问题。注册后提供 300MB 的在线空间,支持 WebDAV 同步,这就意味着可以使用 坚果云 在多设备间进行同步。支持插件,可以更具需要安装各种社区开发者贡献的插件。资料收集功能强大,抓取资料的信息,准确度很高。提供了笔记功能,通过插件可支持 Markdown。标签化管理,全文搜索,支持多种格式的文献信息导入,导出。Zotero 的功能很多,更多功能的介绍和使用说明可查阅 官方文档

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Zotero

根据个人需求选择 Zotero 作为日常使用的文献管理工具。不太推荐同时使用多个文献管理工具,分散管理失去了管理的意义,经常发生记不清某篇文献保存在什么地方的情况。

个人文献管理的需求包括:

  1. 导入各种格式的文献信息,并可导出为 Bibtex 格式 (方便使用LaTexMarkdown写作)。
  2. 能够获取 PDF。这个功能对于所在单位购买的文献数据库不多的情况下尤其好使。从此解决“去什么地方下文献?”的问题。当然这个问题也可以通过手动使用 DOI 解决,但是自动批量下载大部分 PDF,只需手动补充下载部分PDF 的使用体验更好。
  3. 能从浏览器导入条目。很多情况下都是在浏览器中先看需要收集的资料。Zotero提供的浏览器插件可一键导入网页资料。
  4. 多端同步。Zotero暂时没有官方的移动端应用。移动端的作用更多的是阅读,可通过使用坚果云或者微云等第三方同步云盘解决移动端同步的问题。
  5. 作简单的笔记。复杂的标注和笔记可使用 MarginNoteLiquidtextAdobe Reader完成。Zotero没有集成内置的阅读器,个人认为这是一个优点,专业的事情应该给更专业的软件去完成。据悉,最新版本的 Zotero 将集成 PDF 阅读功能,目前该功能还在 beta 阶段。

2. Zotero 使用教程

2.1 安装 Zotero

管网 下载 Zotero, Zotero Connector 支持 Firefox,Edge,Chrome,更具浏览器的使用情况,选择对应的版本下载安装即可。Connector 能方便地将网页内容导入Zotero 中。一路 Next, 完成安装。Zotero 界面非常的简洁。

下载 Zotero
Zotero 安装
Zotero 界面

Zotero 界面

2.2 添加文献信息

Zotero支持以下几种文献信息导添加方式:

  1. 通过浏览器添加;
  2. 将 PDF 直接拖动到 Zotero 中;
  3. 从其他文献管理工具导入;
  4. 手动添加;
  5. 通过 DOI, ISBN, PMID, 或 arXiv ID 添加文献(最赞的功能);
2.2.1. 通过浏览器添加资料

需要安装和浏览器对应的 Zotero Connector, 这里以 Edge为例。

Zotero Edge Connector 安装.png

Zotero Connector 安装 -1

点击获取 Edge Connector

Zotero Connector 安装 -2

点击添加扩展

Zotero Connector 安装 -3

Edge Connector 安装完成后

Zotero Connector 安装 -4

在“文献分类区”空白处点击右键,新建一个“分类”。然后回到浏览器,打开一个需要加入到 Zotero 中页面,点击浏览器右上角“Save to Zotero”图标。在弹出菜单中可选择保存的位置,这里选择刚才新建的文献分类“My library”, 选择好之后,在菜单之外的区域点击一下鼠标,网页就保存到 Zotero 中了。如果网页中包含的文章为 Open Access,Zotero将自动获取改 PDF,并自动抓取文献信息。

:books: tips: 如果在浏览器中查看 PDF,并点击浏览器右上角“Save to Zotero”, PDF 文件将保存到 Zotero 中。如果 PDF 的 Metadata 中包含文章的 Title,Author,DOI 等信息,Zotero将自动获取文献信息。

新建文献分类

Zotero 的工作区

保存网页到 zotero

添加网页到 Zotero

成功保存了网页并抓取了 PDF 和文献信息

成功保存了网页并抓取了 PDF 和文献信息

2.2.2 通过拖放添加文献

最简单,直观的添加文献的方法就是在“文献分类区”选择适当的文献分类,然后将文献直接拖放到 Zotero 的文献区。日常使用中,大多数时候是将 PDF 文件拖放到 Zotero 中。如果 PDF 具有完整的元数据信息,Zotero讲自动抓取这些信息,并根具这些信息建立该文献的“父级条目”。可通过下面的方法查看 PDF 文件的元数据,在 Adobe Reader 中打开了 PDF,在页面上点击右键,选择“文档属性”查看文件的元数据是否完整。由于网络等不可控因素,有时候会发生抓取失败的情况,可以使用手动抓取获取文献元数据。右键点击文献, 选择“重新抓取 PDF 的元数据”即可。抓取完成后,Zotero 自动新建一个该 PDF 的“父级条目”,保存文章,标题,作者,摘要等信息。

在 Chrome,Edge, Firefox 中也可使用类似的方法查看 PDF 文件的元数据。

查看 PDF 文件元数据

查看 PDF 元数据

PDF 文件元数据

PDF 文件元数据

重新抓取 PDF 的元数据

新建父级条目,保存文献信息

成功抓取 PDF 的元数据,新建父级条目,保存文献信息

2.2.3 从其他文献管理工具导入

Zotero支持以下的参考文献信息格式,几乎可导入从任何文献管理工具导出的文献信息。这个功能能再日常使用中带来更大的便利,批量导入文献。比如从知网批量导出的文献信息,可方便的一键导入到 Zotero 中。选择 文件 -> 导入,选择文献信息文件即可。

 
  • Zotero RDF
  • CSL JSON
  • MODS (Metadata Object Description Schema)
  • BibTeX
  • RIS
  • Refer/BibIX
  • Unqualified Dublin Core RDF
  • Endnote XML
  • XML ContextObject
  • Web of Science Tagged
  • MEDLINE/nbib
批量导入文献

批量导入文献

2.2.4 手动添加

当文献信息不能抓取时,需要手动填入对应的文献信息。完整,准确的文献信息可为之后搜索,插入参考文献等提供便利。

右键点击 PDF->Create Parent Item-> Manual Entry 在左侧窗口的 ” 信息 ” 标签下即可输入对应的文献信息。

创建父级条目

创建父级条目

选择手动输入文献信息

选择手动输入文献信息

输入文献信息

输入文献信息

2.2.5 通过 DOI, ISBN, PMID, 或 arXiv ID 添加文献(最赞的功能)

通过 DOI, ISBN, PMID, 或 arXiv ID 添加文献的功能极大的简化了文献导入 Zotero 的工作流程,体验极佳。非要说缺点的话,对中文文献支持不是太好。不过这个不足可以通过插件完美解决 (在插件使用部分说明这个问题),也可以单独使用 CNKI E-Study 管理中文文献。DOI, ISBN, PMID 和 arXiv ID 在Zotero 中称为 标识符 。点击“通过标识符添加条目”,在输入框内输入标识符即可。成功获取文献后,Zotero 将自动把文献信息保存为父条目,并获取相应的PDF, 保存为该条目的附件。

通过标识符添加条目

通过标识符添加条目

2.3 管理文献

2.3.1 文献集合和标签

可以通过“集合 (Collection)”和“标签(Tag)”组织文献。可在一个集合下面再建立子集。标签显示区列出所有的标签,可为每个标签设置不同的颜色。标签和集合应该从不同维度对文献加以区分,比如,已经建立了一个名为“NLP”的集合,就不要再建立一个名为“NLP”的标签。标签可用于标注文献的用途,如“引用”标签用于标注需要引用的文献,序列标签 C1,C2, C3 可用于标注文献的参考价值(重要性) 等。标签不宜太多,无节制的使用标签,长时间积累后将带来检索成本的激增,简直就是检索的灾难。

文献集合和标签

文献集合和标签

2.3.2 检索

Zotero提供了常规的排序方法,满足日常使用。一般来说,没有人会准确的记住某篇文献的题,只有可能记住作者,期刊名字等更容易记住的信息。当一个作者,一个期刊有多篇文献的时候,就不太可能快速而准确的找到需要的某一篇文献。有时候对一篇文献的印象是文字片段,甚至是个别单词。Zotero提供了强大的“全文检索”来解决这个问题。搜索分为三种模式:“标题,创建者,年份”,“所有域 & 标签”和“所有内容”。默认模式为“所有域 & 标签”。“所有内容”模式可搜索 PDF文件的内容,且速度极快,妙出结果!

文献排序.png

文献排序

检索文献

检索文献

2.3.3 添加笔记

Zotero的笔记功能相对简单,只支持简单的格式。可使用插件提供对 Markdown 的支持(请看插件使用部分),高效添加笔记。笔记会以附件的形式保存在父条目下面,并支持导出。

添加笔记

添加笔记

2.4 辅助写作(在文字编辑软件中插入参考文献)

插入参考文献

任何学术写作都需要插入参考文献,调整参考文献样式。手动调整数十篇甚至上百篇参考文献无疑是灾难。Zotero几乎可让你忽略参考文献的存在,流畅地写作,实现 cite while your write。在 Word 中使用 Zotero 插入参考文献,需要保持 Zotero 在后台运行

Zotero默认安装 Zotero Word for Windows Integration 插件,在 Word 工具栏会出现一个 Zotero 标签。点击Add/Edit Citation, 选择参考文献的样式,这里以 APA 样式为例。然后在 Zotero 文献搜索框内输入关键字找到要引用的文献,以引用“Investigation and Analysis of Villagers Participation in Protection of Traditional Villages——Case study in Shaxi”为例,找到要引用的文献之后,回车,再点击Add/Edit Bibliography。需要更改参考文献样式的时候,点击Document Preferences, 选择需要的样式即可。

完成参考文献插入之后,Zotero会自动管理参考文献,修改完文章后点击Refresh,参考文献的编号,排序都自动完成,不会发生任何编号混乱。

在 Word 中插入参考文献

在 Word 中插入参考文献

选择参考文献样式

选择参考文献样式

插入参考文献

插入参考文献

完成参考文献添加

完成参考文献添加

添加参考文献样式

默认安装已经包含了常用的参考文献样式,但不包括中文的参考文献样式。可以手动添加参考文献样式。点击 编辑 -> 首选项 打开设置界面,选择 引用 标签,点击 获取更多样式(在右下角的“+”号,可手动添加本地样式文件), 在搜索框中输入关键词Chinese,选择要添加的参考文献样式。有些期刊会提供参考文献样式,下载样式文件之后,手动添加即可。

添加参考文献样式

添加参考文献样式

选择要添加的参考文献样式

选择要添加的参考文献样式

完成添加参考文献样式

完成添加参考文献样式

2.5 使用插件

2.5.1 安装插件

Zotero支持 .xpi类型的插件,软件本身没有集中列出可用 Plugins 的界面,但官方文档给出了一些插件的 链接 。在 Github 上也能找一些插件。通过 工具 -> 插件 进入插件管理页面,可将下载好的 .xpi 文件拖放到插件页面进行安装,也可以通过 Tools for all add-ons(右上角的齿轮图标) -> install add-on from file 安装插件。

安装插件

安装插件

2.5.2 必备插件
  1. Zotfile: Zotfile is a Zotero plugin to manage your attachments: automatically rename, move, and attach PDFs (or other files) to Zotero items, sync PDFs from your Zotero library to your (mobile) PDF reader (e.g. an iPad, Android tablet, etc.) and extract annotations from PDF files.
  2. Better BibTex for Zotero: Better BibTeX (BBT) is an extension for Zotero and Juris-M that makes it easier to manage bibliographic data, especially for people authoring documents using text-based toolchains (e.g. based on LaTeX / Markdown).
  3. Markdown Here:支持 Markdown 笔记。
  4. Jasminum:

    一个简单的 Zotero 中文插件(这个插件并不是 Zotero translator),实现的功能有:

    1. 拆分或合并 Zotero 中条目作者姓和名
    2. 根据知网上下载的文献文件来抓取引用信息(就是根据文件名)
    3. 添加中文 PDF/CAJ 时,自动拉取知网数据,该功能默认关闭。需要到设置中开启,注意添加的文件名需要含有中文,全英文没有效果(还是根据文件名)
    4. 为知网的学位论文 PDF 添加书签
    5. 更新中文 translators
    6. 拉取文献引用次数,是否核心期刊

正文完
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